新型コロナ・ウイルス感染拡大を考慮して、日本バプテスト連盟の各教会では礼拝を中止するところもある。礼拝がある教会でも、時間短縮をしたり、昼食や教会学校や主の晩餐、祈祷会などを中止しているという。
日本バプテスト連盟のホームページ
現在分かっているのは以下のとおり。
北海道
○帯広バプテスト・キリスト教会（川内裕子、川内活也牧師）
８日は両牧師のみで会堂にて短縮プログラムで行い、それをユーチューブでライブ配信。
○札幌バプテスト教会（石橋大輔牧師）
８日まで、礼拝およびすべてのプログラムを休止。
○西野バプテスト教会（岩本義博牧師）
８日、礼拝休止。
○リビングホープ・バプテスト教会（牧師不在）
８日まで、礼拝、祈祷会を休止。
○苫小牧バプテスト教会（田代仁牧師）
１４日まで主日礼拝、祈り会、祈祷会を休止。
○小樽バプテスト教会（エイカーズ愛牧師）
１４日まで礼拝、集会、プログラムを休止。
山形県
○山形キリスト教会（杉山修一牧師）
８日、礼拝休止。
東京都
○茗荷谷キリスト教会（平尾輝明牧師）
１４日まで全面休止。
○常盤台バプテスト教会（友納靖史牧師）
１５日までを感染防止重要期間とし、２月２９日より教会を閉鎖し、すべての礼拝、祈祷会、教会学校、その他の集会を休止。
○志村バプテスト教会（常廣澄子牧師）
１４日まで、礼拝、祈祷会、教会学校、ハンドベルクラスを休止。
○蓮根バプテスト教会（高木康俊牧師）
１４日まで、すべての礼拝、集会は休止。１５日以降再開予定だが、ウイルス感染の拡散状況によっては礼拝・集会休止の延長もある。
○恵約宣教伝道所（藤原淳賀牧師）
３週間はインターネット配信での礼拝。
○福生バプテスト・キリスト教会（稲見元彦牧師）
８日は動画礼拝。
○調布南キリスト教会（前田重雄牧師）
８日、礼拝中止。
○府中キリスト教会（長尾なつみ牧師）
８日、教会閉鎖。
○多摩みぎわキリスト教会（石井規之牧師）
１５日まで礼拝およびすべての集会を中止。
神奈川県
○横浜戸塚バプテスト教会（堀野浩嗣牧師）
１５日まで、集まれる人だけで礼拝を行い、ユーチューブでライブ礼拝。
石川県
○金沢キリスト教会（田口昭典牧師）
８日、主日礼拝と英語礼拝は休止。１５日より再開予定だが、新型肺炎の動向により、再開日の変更あり。
徳島県
○徳島キリスト教会（杉山いずみ牧師）
８、１５日の礼拝中止。
佐賀県
○嬉野基督教会（藤野慶一郎牧師）
８日は、礼拝堂での礼拝は休止し、各家庭か小グループで行う。
日本バプテスト連盟は、米国で最も信徒数が多い南部バプテスト連盟により、戦前から九州を中心に伝道が行われ、戦後は全国に広がった。南部バプテスト連盟は福音派だが、日本バプテスト連盟は主流派。自覚的な信仰告白をしてから「バプテスマ」（「洗礼」と言わない）を受けることが特徴で、カトリックなどの幼児洗礼を認めない。また、他教派は滴礼（額に水を垂らすこと）が多いのに対して、全身で水に浸かる全浸礼を行う。それぞれの教会ごとに独立した各個教会主義で、教会員による総会によって物事を決める会衆制であり、牧師や役員が決める監督制や長老制ではない。
