最新の文化庁編『宗教年鑑』（令和元〔２０１９〕年版）によると（８０～８５頁）、カトリックや改革派など、少し増えているところもあるが、全体的に減少傾向にあり、特にプロテスタント主流派の落ち込みが激しい（以下数字は、２０１８年１２月３１日現在）。特に教派の順位に変動はなかった。
信者数は９５万３４６１人。これまでの推移を見ると、９５万９６４０人（１８年）、９６万２５３人（１７年）、９６万８０６６人（１６年）と、４年間で１万４６０５人（約２％）減っている。
教会の総数は５８２０。しかしこちらは、５８１８（１８年）、５７６３（１７年）、５７４３（１６年）と、信徒が減っているのに教会数は７７も増えている。
日本の総人口１億２６０２万人（２０年１月１日現在、総務省統計局の概算値）のうち、クリスチャンは０・７６％となる。
『宗教年鑑』では、文部科学大臣所轄包括宗教法人として登録されている教会のみを扱っている。また、各宗教法人による「報告」に基づいてまとめられているため、正確な実数とは言えず、礼拝やミサに毎週集うクリスチャンになると、実際にはもっと少ないと考えられる。
「異端」とされるモルモン教（末日聖徒イエス・キリスト教会）なども、包括宗教団体のために入っている。ちなみにモルモン教は信者数１２万７５３６人（前年１２万７１６６人で、３７０人増えている）。教会数２６１（前年同）。
各教派の信徒数ランキングを２０位まで見ていく。
キリスト教は大きくカトリックと正教会、プロテスタントがあり、プロテスタントはさらにさまざまな教派に分かれている。
１位はカトリックで、４４万８９３人（クリスチャンのうち約４６％。以下、１％未満は計算しない）。２００９年の４５万２１３６人をピークに減少傾向にあるが、前年の４４万８３２人（１８年）より６１人増加した。１９８６年版では３９万３５９人なので、この３４年間で５万５３４人（１３％）増えている。教会数は７７７で、前年の７７８（１８年）から一つ減っている。
カトリックは世界最大のキリスト教の教派で、全世界に約１３億人の信者がいる（世界総人口の約１８％）。プロテスタントは日本独自の組織を持ち、礼拝などのあり方もさまざまだが、カトリックは世界組織で、ミサのあり方も世界共通だ。
２位は日本基督教団で、１１万１０９０人（クリスチャンのうち約１２％）。１１万５５０２人（１８年）、１１万７７７３人（１７年）、１１万９２２３（１６年）と、４年で８１３３人（約７％）も減少し、前年からは４４１２人（約４％）減った。１９８６年版では１３万９２４７人なので、３４年間で２万８１５７人（２０％）も減っている。教会数は１５１４で、前年の１５１９（１８年）から５つ減っている。
日本基督教団は、戦時中にプロテスタント諸教派が合同されてできた。そのため戦後、ルーテルやバプテストなど、教派的伝統を重んじて独立した教派も多くあったが、今なお日本最大のプロテスタントの教団だ。そのため、特色の違う長老改革系と組合系の教会などが混在する。
プロテスタントは１６世紀、ルターやカルヴァンらが進めた宗教改革によってカトリックから分かれ、以後、ルター派、改革派、メソジスト、バプテストなど、その聖書解釈や信仰告白、強調点の違いなどで分裂した。
主流派は日本キリスト教協議会（ＮＣＣ）、福音派は日本福音同盟（ＪＥＡ）に加盟している教団・教派とすると、日本基督教団は主流派。
３位は日本聖公会で、４万７８８６人（クリスチャンのうち約５％）。４万８４４９人（１８年）、４万９２２８人（１７年）、５万５１２（１６年）と、４年間で２６２６人（約５％）も減少し続け、前年から５６３人減っている。１９９９年の５万８３８２人をピークに１万４９６人（約１８％）も減っている。教会数は２８１で、前年まで２７９だったが、二つ増えた。
日本聖公会は、プロテスタントの中でもカトリックに最も近い英国国教会の流れにある米国聖公会などの宣教師により１８８７年に創設された。主流派。（②に続く）
